Identification of SARS-CoV-2 in urban rodents from Southern Mexico City at the beginning of the COVID-19 pandemic

ABSTRACT Currently, there are some concerns about the situation and, in particular, about the future of the COVID-19 pandemic and the new emerging variants of SARS-CoV-2. Rodents are an example of synanthropic animals in urban environments that harbor important zoonoses. Although the molecular identification of SARS-CoV-2 in Rattus norvegicus from New York City had been reported, in other studies, urban wild rodents infected with this virus have not been found. This study aimed to molecularly identify the presence of SARS-CoV-2 in urban wild rodents from Mexico City, trapped along a water channel of a public park as part of a pest control program, at the beginning of the COVID-19 pandemic, during the fall and winter of 2020. Up to 33 Mus musculus and 52 R. norvegicus were captured and euthanized, large intestine samples with feces from the animals were obtained. RNAs were obtained and subjected to qRT-PCR for SARS-CoV-2 identification and threshold cycle (Ct) values were obtained. Four mice (12.1%) and three rats (5.8%) were positive, three rodents exhibited Ct<30. Our results on the frequency of SARS-CoV-2 in urban rats are in line with other previous reports. Thus, similar to other authors, we suggest that surveillance for the detection of SARS-CoV-2 in urban wild rodents, as sentinel animals, should be maintained.

Percepção da sociedade em relação ao controle populacional de vertebrados em condições de sinantropia no município de Niterói, RJ / Perception of society about the management of synanthropic vertebrates populations in the municipality of Niterói, RJ / Percepción de la sociedad sobre el control poblacional de los vertebrados en condiciones sinópticas en el municipio de Niterói, RJ

Esse estudo seccional, realizado no período 2014-2015, com aplicação de questionários, teve por objetivo conhecer a percepção sobre vertebrados em condição de sinantropia e a opinião sobre controle populacional para a população do município de Niterói, RJ. Dentre os 474 entrevistados, 76,8% aceitavam o controle populacional para ratos, 63,3% para pombos, 40,5% para cães, 33,8% para gatos, 25,5% para morcegos, 16,5% para serpentes e 14,1% para gambás. As serpentes foram os animais mais associados ao medo (59,1%) e risco de agressão (47,7%), pombos (89,2%) e morcegos ao risco de doenças (57,4%), ratos à nojo/repulsa (56,6%), gambás à natureza (73,8%), cães à companhia (79,8%), e gatos à amizade (57,4%). O estudo demonstrou que as relações dos humanos com os animais podem ser complexas, ambíguas e paradoxais, e fornece dados que poderão ser utilizados para políticas públicas de manejo dessas espécies.(AU)

This study (sectional investigation), in the 2014-2015, using questionnaires, aimed to understand the perception of vertebrates in synanthropic conditions and the opinion about their population control for the population of the municipality the Niterói, RJ. Among the 474 people interviewed, 76.8% accepted population control for rats, 63.3% for pigeons, 40.5% for dogs, 33.8% for cats, 25.5 % for bats, 16.5% for snakes and 14.1% for possums. Snakes were the animals most associated with the representation of fear (59.1%) and risk of aggression (47.7%), pigeons (89.2%) and bats with risk of disease (57.4%), rats with disgust and repulsion (56.6%), possums with nature (73.8%), dogs with company (79.8%), and cats with friendship (57.4%). In addition to demonstrating how complex human relations with animals can be ambiguous and paradoxical, this study provides data that can be used for public policies for the management of these species.(AU)

El objetivo de este estudio fue conocer la percepción de los vertebrados en condiciones de sinantropía y la opinión sobre el control poblacional de la población del municipio de Niterói, RJ. Entre los 474 entrevistados, el 76,8% aceptó el control de la población de ratas, el 63,3% de palomas, el 40,5% de perros, el 33,8% de gatos, el 25,5% de murciélagos, el 16,5% de serpientes y el 14,1% de zarigüeyas. Las serpientes fueron los animales más asociados al miedo (59,1%) y al riesgo de agresión (47,7%), las palomas (89,2%) y los murciélagos al riesgo de enfermedad (57,4%), las ratas al asco/repulsión (56,6%), las zarigüeyas a la naturaleza (73,8%), los perros a la compañía (79,8%) y los gatos a la amistad (57,4%). El estudio demostró que las relaciones de los humanos con los animales pueden ser complejas, ambiguas y paradójicas, y aporta datos que podrían utilizarse para las políticas públicas de gestión de estas especies.(AU)

Perfil das reclamações registradas acerca de roedores do Distrito Federal, Brasil / Profile of registered complaints about rodents of the Federal District, Brazil

Os animais sinantrópicos, dentre eles os roedores, contituem problema de saúde pública em áreas urbanizadas. Foi realizado levantamento das reclamações sobre roedores feitas para o setor de animais sinantrópicos da Diretoria de Vigilância Ambiental doDistrito Federal no intervalo entre 2014 e 2016. As solicitações atingiram o número de 10.232, sendo 4.429 em 2014, 4.368 e 1.429 nos respectivos anos subsequentes. A queda expressiva é decorrente da ausência de telefone no Órgão, se tratando da forma de comunicação mais utilizada para execução das solicitações. Quando relacionados a população das Regiões Administrativas com a quantidade de reclamações, houve relação, mas o mesmo não ocorreu com renda per capita e grau de escolaridade. 6.902 ocorrências foram em residências, justificadas pela população ansiando por desratização gratuita. Houve 11.901 casos confirmados de leptospirose no Brasil nos anos estudados. Destes, 82 ocorreram no DF. Mesmo que maiores os valores utilizados em programas de controle de roedores quando comparados a despesas com zoonoses transmitidas por esses animais, sendo custos diretos médicos, diretos não médicos, indiretos não mensuráveis, o bem-estar da sociedade deve ser destacado.

Synanthropic animals, including rodents, contain the public health problem in urbanized areas. A survey of rodent complaints made to the synanthropic animal sector of the Federal District Environmental Surveillance Directorate was carried out between 2014 and 2016. The occurrences reached 10,232, with 4,429 in 2014, 4,368 and 1,429 in subsequent years. The significant drop is due to the absence of a telephone in the Agency, being the most used form of communication for executing executions. When related to the population of the Administrative Regions with the number of complaints, there was a relationship, but the same did not occur with per capita income and education level. 6,902 occurrences were in homes, justified by the population yearning for free rat removal. There were 11,901 confirmed cases of leptospirosis in Brazil in the years studied. Of these, 82 occurred in the DF. Even though the values used in rodent control programs are higher when compared to expenses with zoonoses transmitted by these animals, being direct medical costs, non-medical direct costs, non-measurable indirect costs, society’s well-being must be highlighted.

Perfil das reclamações registradas acerca de roedores do Distrito Federal, Brasil / Profile of registered complaints about rodents of the Federal District, Brazil

Os animais sinantrópicos, dentre eles os roedores, contituem problema de saúde pública em áreas urbanizadas. Foi realizado levantamento das reclamações sobre roedores feitas para o setor de animais sinantrópicos da Diretoria de Vigilância Ambiental doDistrito Federal no intervalo entre 2014 e 2016. As solicitações atingiram o número de 10.232, sendo 4.429 em 2014, 4.368 e 1.429 nos respectivos anos subsequentes. A queda expressiva é decorrente da ausência de telefone no Órgão, se tratando da forma de comunicação mais utilizada para execução das solicitações. Quando relacionados a população das Regiões Administrativas com a quantidade de reclamações, houve relação, mas o mesmo não ocorreu com renda per capita e grau de escolaridade. 6.902 ocorrências foram em residências, justificadas pela população ansiando por desratização gratuita. Houve 11.901 casos confirmados de leptospirose no Brasil nos anos estudados. Destes, 82 ocorreram no DF. Mesmo que maiores os valores utilizados em programas de controle de roedores quando comparados a despesas com zoonoses transmitidas por esses animais, sendo custos diretos médicos, diretos não médicos, indiretos não mensuráveis, o bem-estar da sociedade deve ser destacado.

Synanthropic animals, including rodents, contain the public health problem in urbanized areas. A survey of rodent complaints made to the synanthropic animal sector of the Federal District Environmental Surveillance Directorate was carried out between 2014 and 2016. The occurrences reached 10,232, with 4,429 in 2014, 4,368 and 1,429 in subsequent years. The significant drop is due to the absence of a telephone in the Agency, being the most used form of communication for executing executions. When related to the population of the Administrative Regions with the number of complaints, there was a relationship, but the same did not occur with per capita income and education level. 6,902 occurrences were in homes, justified by the population yearning for free rat removal. There were 11,901 confirmed cases of leptospirosis in Brazil in the years studied. Of these, 82 occurred in the DF. Even though the values used in rodent control programs are higher when compared to expenses with zoonoses transmitted by these animals, being direct medical costs, non-medical direct costs, non-measurable indirect costs, society's well-being must be highlighted.

Gastrointestinal parasites in feral cats and rodents from the Fernando de Noronha Archipelago, Brazil / Parasitos gastrointestinais em gatos ferais e roedores do Arquipélago de Fernando de Noronha, Brasil

Abstract Gastrointestinal parasites are important pathogens affecting animals, some of them are of medical and veterinary concern. Although the dynamic of parasitic infections is a complex phenomenon that has been studied under experimental conditions, it shows several gaps in knowledge, especially in insular regions where a confined population of animals and parasites co-exists. In this study was assessed the parasitism by endoparasite gastrointestinal in feral cats (n = 37) and rodents (n = 30) from the Fernando de Noronha Archipelago; in addition, the risk of human infection and ecological implications of these findings were discussed. Out of all samples analysed, 100% scored positive for the presence of gastrointestinal parasites in both feral cats and rodents. A total 17 genera and/or species of endoparasite gastrointestinal were identified, Ancylostoma sp., Strongyloides sp., Trichuris campanula and Toxocara cati were the parasites more frequently in feral cats. In rodents Eimeria sp., Strongyloides sp. and Trichuris muris were parasites more frequently herein detected. Human population living in this area are at risk of parasite infections due to the population of rodents and feral cats in the archipelago.

Resumo Parasitas gastrointestinais são importantes agentes patogênicos que afetam os animais, sendo alguns destes de interesse médico e veterinário. Embora a dinâmica das infecções parasitárias seja um fenômeno complexo que tem sido estudado sob condições experimentais, existem várias lacunas no conhecimento, especificamente em regiões insulares onde existem populações confinadas de animais e parasitas. Neste estudo foi avaliado o parasitismo por endoparasitas gastrointestinais em gatos ferais (n = 37) e roedores (n = 30) do Arquipélago de Fernando de Noronha. Além disso, discutiu-se o risco de infecção humana e implicações ecológicas desses achados. De todas as amostras analisadas, 100% obtiveram resultados positivos para a presença de parasitos gastrointestinais tanto em gatos ferais quanto em roedores. Um total de 17 gêneros e/ou espécies de endoparasitos gastrointestinais foram identificados, Ancylostoma sp., Strongyloides sp., Trichuris campanula e Toxocara cati foram os parasitos mais frequentes em gatos ferais. Em roedores Eimeria sp., Strongyloides sp. e Trichuris muris foram os mais detectados. A população humana que vive nesta área corre o risco de infecções parasitárias, devido à população de roedores e gatos ferais no arquipélago.

Calodium hepaticum (Nematoda: Capillariidae) in synanthropic rodents (Rattus norvegicus and Rattus rattus) in Eastern Amazonia / Primeiro relato de Calodium hepaticum (Nematoda:Capillariidae) em roedores sinantrópicos (Rattus norvegicus e Rattus rattus) na amazonia oriental

Calodium hepaticum (syn. Capillaria hepatica) is a trichurid nematode that parasitizes the hepatic parenchyma of rodents and other mammals. Infections in humans are rare, although they have been reported worldwide. A number of factors contribute to the distribution of this zoonosis, particularly the presence of dense populations of rodents associated with relatively poor urban environments, such as those found in parts of the northern Brazilian city of Belém in the eastern Amazon Basin. This study quantified Calodium infections in commensal synanthropic rodents in Belém. Rodents were captured in three neighborhoods characterized by poor public sanitation and the city's highest incidence of human leptospirosis. A total of 50 rodents were captured (26 Rattus rattus and 24 R. norvegicus), and 23 (10 R. rattus and 13 R. norvegicus) presented macroscopic lesions typical of C. hepaticum. Light microscopy of fresh samples and histological specimens permitted the identification of larvae and adult specimens containing numerous eggs with a double-striated shell and bipolar opercula with plugs. This is the first report of C. hepaticum in R. rattus and R. norvegicus from the Amazon Basin, and it shows a considerable risk of transmission to the local human population.

Calodium hepaticum (syn. Capillaria hepatica) é um nematódeo trichurídeo parasito de parênquima hepático de roedores e outros mamíferos. As infecções em humanos são raras, mas são relatadas em diversas regiões do mundo. Numerosos fatores contribuem para a distribuição desta zoonose, particularmente, uma densa população de roedores associada com ambientes urbanos com carência de saneamento básico, tais como aqueles encontrados em algumas cidades da região Norte do Brasil, como a cidade de Belém, localizada na Amazônia Oriental. Este estudo quantifica e demonstra a infecção por Calodium em roedores comensais sinantrópicos, de três bairros da cidade de Belém, Estado do Pará, com carência de saneamento público e alta incidência de leptospirose humana. Um total de 50 roedores foram capturados para análise (26 Rattus rattus e 24 R. norvegicus) e destes, 23 (10 R. rattus e 13 R. norvegicus) apresentaram típicas lesões hepáticas, macroscópicas, causadas por C. hepaticum. A análise de amostras por microscopia de luz direta e histopatológica do fígado dos roedores permitiu a identificação de espécimes desse parasito em fase larvar e adulta, além de numerosos ovos apresentando dupla casca estriada e dois tampões operculares. Este é o primeiro registro da ocorrência de C. hepaticum in R. rattus and R. norvegicus na região Amazônica, alertando para um considerável risco de transmissão para a população humana.

Epidemiological factors related to the transmission risk of Trypanosoma cruzi in a Quilombola community, State of Mato Grosso do Sul, Brazil / Aspectos epidemiológicos relacionados ao risco de transmissão de Trypanosoma cruzi em comunidade Quilombola, Estado de Mato Grosso do Sul, Brasil

INTRODUCTION: This work was an epidemiological investigation of the risk of Trypanosoma cruzi transmission in the rural Quilombola community of Furnas do Dionízio, State of Mato Grosso do Sul, Brazil. METHODS: Of the 71 animals examined, seven were captured (two opossums, Didelphis albiventris; four rats, Rattus rattus; and one nine-banded armadillo, Dasypus novemcinctus) and 64 were domestic (one canine, Canis familiaris; five pigs, Sus scrofa; two bovines, Bos taurus; five caprines, Capra sp.; and 51 ovines, Ovis aries). Parasitological tests were performed to detect parasites in the blood and to identify the morphology of flagellates. These methods included fresh examinations, buffy coat tests and blood cultures. Molecular analysis of DNA for identification of trypanosomatids was performed by polymerase chain reaction (PCR) with primers S35 and S36. RESULTS: The parasitological tests showed flagellates in an opossum and two cattle. The molecular tests showed DNA from T. cruzi in an opossum and a pig. Triatoma sordida was the only triatomine species found in the community, and it colonized households (four specimens) and the surrounding areas (124 specimens). Twenty-three specimens tested positive for flagellates, which were subsequently identified as T. cruzi by PCR. CONCLUSIONS: Data analysis demonstrated that T. cruzi has a peridomestic life cycle that involves both domestic and wild mammals.

INTRODUÇÃO: Este trabalho foi uma investigação epidemiológica do risco de transmissão de Trypanosoma cruzi na comunidade rural Quilombola de Furnas do Dionízio, Estado de Mato Grosso do Sul. MÉTODOS: Dos 71 animais examinados, sete foram capturados (dois gambás, Didelphis albiventris; quatro ratos, Rattus rattus; e um tatu, Dasypus novemcinctus) e 64 eram domésticos (um canídeo, Canis familiaris; cinco suínos, Sus scrofa; dois bovinos, Bos taurus; cinco caprinos, Capra sp; e 51 ovinos, Ovis aries). Exames parasitológicos foram realizados para detectar parasitas no sangue e para identificar a morfologia dos flagelados. Estes métodos incluíram exame a fresco, exame do creme leucocitário e hemocultura. A análise molecular de DNA para identificação de tripanossomatídeos encontrados foi feita pela reação em cadeia da polimerase (PCR) com os primers S35 e S36. RESULTADOS: Os exames parasitológicos mostraram flagelados em um gambá e nos dois bovinos. Os testes moleculares mostraram a presença do DNA de T. cruzi em um gambá e um suíno. Triatoma sordida foi a única espécie de triatomíneo encontrada na comunidade colonizando domicílio (quatro espécimes) e peridomicílio (124 espécimes). Vinte e três amostras foram positivas para flagelados e identificados como T. cruzi pela PCR. CONCLUSÕES: A análise dos dados aponta para o ciclo peridoméstico do parasita e envolve tanto animais domésticos como selvagens.

Plano de ação para o controle da leptospirose no zoológico municipal de Uberaba-MG / Plan of action for the leptospirosis control of the zoo municipal Uberaba-MG

Epizootias em animais Silvestres podem ter reflexos na saúde pública, sendo o ambiente de cativeiro um excelente modelo para fins de estudos de vigilância epidemiológica, principalmente da leptospirose. A participação de animais silvestres, essencialmente roedores, na cadeia da leptospirose é fato indiscutível. Em geral comportam-se como portadores permanentes de vários sorovares de Leptospira. A Leptospirose é uma enfermidade bacteriana de caráter zoonótico que afeta os animais domésticos, silvestres e o humano. Conforme o estudo retrospectivo da prevalência da Leptospira no Zoológico de Uberaba, dos animais estudados, 17 (12,98%) foram reagentes para presença de anticorpos contra Leptospira spp, com isso objetivou-se implantar o plano de ação contra roedores, salientando a participação de várias espécies animais como reservatórios do agente etiológico desta enfermidade, demonstrando as adaptações que o agente tem desenvolvido para manter-se viável na natureza.O estabelecimento de medidas para controle da leptospirose no Zoológico compreendeu vários aspectos, dentre eles o manejo integrado de praga e vetores, onde o enfoque foi o controle de roedores e a atividade educativa para a conscientização da população e funcionários. O combate aos roedores está relacionado, cada vez mais, ao conhecimento de sua biologia, hábitos, habilidades e capacidade física, bem como no meio ambiente onde estes animais estão localizados.

Epizootics in wild animals can have effects on public health and the environment in captivity an excellent model for studies of epidemiological surveillance, especially leptospirosis. The participation of wild animals, mainly rodents, in the chain of leptospirosis is indisputable fact. In general behave as permanent carriers of various serovars of Leptospira. Leptospirosis is a bacterial disease of zoonotic character that affects domestic animals, wild and human. As the retrospective study of the prevalence of Leptospira in the Zoo of Uberaba the animals studied, 17 (12.98%) were positive for antibodies against Leptospira spp, thus aimed to implement the action plan against rodents, emphasizing the participation of various animal species as reservoirs of the etiologic agent of this disease, showing the changes that the agent is designed to remain viable natureza.O establish measures for control of leptospirosis at the zoo spread in several ways, among them the integrated pest and vector, where the focus was the control of rodents and educational activities to raise awareness of the population and staff. The fight against rodents is connected, increasingly, knowledge of its biology, habits, skills and physical ability, as well as the environment where these animals are located